病原微生物也大量繁殖。加工为生物农药。如①细菌。以苏芸金杆菌（Bt）最普通，主要防治鳞翅目害虫;用日本金龟杆菌防治日本金龟子。印度从茶园土壤中分离出变形杆菌（Proteus sp.）,用1：100水溶液喷施茶树，对小绿叶蝉和茶橙瘿螨很有效;②真菌。如白僵菌、绿僵菌、青虫菌、黑刺粉虱韦伯痤孢菌等。用的还有虫霉、链霉菌等菌种的代谢菌（Bbassisna vaill）871菌株，每公斤菌粉可杀死土中65％的幼虫和蛹，出土成虫僵死率达80％，且对瓢虫、蜘蛛等天敌无致病性。③昆虫病毒。我国的病毒资源十分丰富，据不完全统计，目前已从40多种害虫中分离出60多种病毒，已在生产上应用的主要有核多角体病毒（如茶尺蠖NPV）、颗粒体病毒（如茶小卷叶蛾GV）.其特点是寄主专一性强;在自然界滞留时间长，常能引起流行病，但现仍须通过活体繁殖；日本已大规模采用病毒防治茶小卷叶蛾和茶卷蛾，并在鹿儿岛建立了5个颗粒体病毒繁殖基地，4－6，名工人可生产出供1000－2000公顷面积病毒。⑤病原原生动物。