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1958年,中央农业部决定在杭州建立中国农业科学院茶叶研究所,李联标是筹建人之一,从所址选择、土地征用、基本建设、人才培训、学科设置与课题确立等,他无不亲自参与。建所初期,许多研究人员来自全国各地,科研业务不熟,他凭着多年从事试验研究的经验,组织讨论、座谈、报告会、参观交流等,想方设法提高试验研究水平。他要求科研人员既要着重研究当前生产中存在的重要技术问题,重视总结茶农技术经验,同时也要注意对基础理论的研究。当年的同事都把他当做良师益友,无不乐于聆听他的教诲与指导。
1960~1966年间,李联标先后为前苏联、尼泊尔、喀麦隆、越南等国的留学生和进修生讲授茶树栽培学,并进行实习和辅导。他们中的许多人已成了这些国家茶叶生产或科研部门的主管。晚年,他仍不辞劳苦招收研究生,为培养高层次人才继续奉献。