1936年，张志澄大学毕业，随恩师彭先泽去江苏稻作试验场吴县虎丘西廊桥分场工作，不久就任分场场长。1937年，日军入侵江南，他忍痛与同事们撤离。张志澄艰苦跋涉，于1938年3月抵达重庆。直至1939年11月，张志澄与吴觉农面晤后才进入中国茶叶公司技术处工作，从此踏上了他为之奋斗终身的茶业之路。

1940年，复旦大学农学院设立了我国第一个本科茶叶系，张志澄受中国茶叶公司派遣，成为该系第一任茶树栽培学讲师。困难当头，新筹建的茶叶系缺少教学设备和教材，国内无系统的茶学专业资料，张志澄凭借自己农学、园艺和植物栽培方面扎实的理论基础，参阅了仅有的几本自外茶树栽培资料、借鉴相近作物栽培的教材，于1941年完成了《茶树栽培学》教材的编写。为了加深学生的感性认识，他经常带领学生，徒步翻山越岭深入茶区实习。这种理论联系实际的方法、严谨的治学精神培养了一代中国茶业界骨干人才。

1944年，张志澄离开复旦大学茶叶系，前往四川水产学校任教，抗日战争胜利后随校迁往江苏崇明。1949年5