印度于2002年正式批准出售Bt棉花。而在此之前，一种棉铃虫害一直使棉花的产量减半。在10年里，Bt棉花已被近700万印度农民所接受，并已覆盖97%的棉花田，同时产量增加了一倍，杀虫剂的使用减少了一半。

　　但是研究人员一直在争论，如果真是这样，那么产量的增加有多少归因于Bt技术。那些购买了昂贵的GM种子的农民同时还会开始灌溉并施用肥料以保护他们的投资，因此任何观察到的增长或许都缘于更好的耕种。这项调查还选取了那些富裕的、技术进步的农民作为研究对象，这些人能够负担得起GM种子，并且他们的耕种技术也足以获得高产量而无论是否采用了转基因技术。

　　Qaim表示，他的这项研究利用一个能够控制那些可提升产量且未被观察到的变量——例如更棒的耕种环境和技术水平——的统计模型来对这些偏见作出解释。他说，这使得研究人员能够观察到源自Bt的收益。

　　然而美国华盛顿哥伦比亚特区国际粮食政策研究所的资深研究员Guillaume Gruere警告说，对农民的调查或许并不能够在总体上反映Bt对印度平均棉花产量的贡献。

　　Gruere说：“这项研究基于已有的数据，尽管这些是原始的调查结果，但你并不能进入所有的地区以及覆盖每一种情况。就像在一次政治投票中总会有一个误差范围。”

　　在印度，棉花被种植在各种各样的土壤、气候条件和害虫环境中，并且在印度中部和南部行得通的事在北部却未必是这样。事实上，各地的农民所得到的好处或许并非是一致的。

　　这种不一致体现在由印度政府采集的统计信息上。根据印度棉花公司提供的数据，有史以来最大的产量出现在马哈拉施特拉邦——这里是印度中部和南部最大的棉花种植地区，2010年平均每公顷棉花产量为1065公斤。印度那格浦尔市棉花研究中央研究所所长Keshav Raj Kranthi表示，这一数字远远低于最新研究报告的每公顷2072公斤的最高产量。其他利用政府统计数据撰写的报告也曾显示了更为适度的增产。

　　Kranthi指出，这些收益在多大程度上缘于Bt基因仍然是一个问题。但总体来说，Bt棉花似乎对印度农民是有利的。“Bt技术是辉煌的。”他说，“你无法想象如果没有经济利益，农民会作出这样的选择。”